起動中のバックアップJobをユーザー側で停止後にJobを再開させることは可能ですか?

可能です。

例)起動中のJob(A)をユーザーが停止後にJob(A)を再開した場合にはJob(A)が正常終了して作成しているバックアップファイルからの変更部分(増分、差分)のバックアップファイルを作成します。

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Backup Jobを一度ユーザが手動で停止してもJobを再実行することで継続して使用できますか?

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